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HDF5 is a data model, library, and file format for storing and managing data. It can represent very complex data objects and a wide variety of metadata.

Documentation

For a documentation visit the HDF group support portal

Installed versions

Serial HDF5

The libraries are threadsafe and can be used in omp-parallel codes.

Parallel hdf5

VersionCompiler, MPIModuleAPI
1.10.5intel/18.0.6, impi/2018.5hdf5-parallel/impi/intel/1.10.5v110
1.10.6intel/18.0.6, impi/2018.5hdf5-parallel/impi/intel/1.10.6v110

1.10.6

intel, openmpi/intel/3.1.6

hdf5-parallel/ompi/intel/1.10.6v110

1.10.5

gcc/8.3.0, openmpi/gcc.9/3.1.5

hdf5-parallel/ompi/gcc.8/1.10.6v110

1.10.5

gcc/9.2.0, openmpi/gcc.9/3.1.5hdf5-parallel/ompi/gcc.8/1.10.6v110
1.12.0gcc/8.3.0, openmpi/gcc.9/3.1.5hdf5-parallel/ompi/gcc.8/1.12.0v112

The libraries are threadsafe and can be used in omp-parallel codes.

obsolete versions

Modules

Example Jobscripts

#!/bin/bash
#SBATCH -p

module load
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